Alexander Mahone

Lorsque Mahone est transféré à Sona, par un temps de pluie, il s'aperçoit que Michael Scofield s'y trouve également et tous deux se lancent mutuellement un regard froid. Peu après, Alexander Mahone essayera de sympathiser un peu avec Michael mais celui-ci refuse de lui adresser la parole en affirmant qu'il ne veut pas parler à celui qui a tué son père. Par la suite, lorsque Michael se voit obligé de livrer un duel à mort avec l'un des prisonniers qui l'accuse d'avoir volé sa drogue, Mahone n'hésite pas à donner des conseils à Michael ("taper fort dans la rotule de l'adversaire") afin que celui-ci remporte à tout prix le duel car Mahone avoue à Michael qu'il est sa seule carte de sortie de cet endroit sauvage qu'est Sona. Lors du duel en question, lorsque l'adversaire de Michael s'apprête à lui asséner un coup de couteau (ce qui est normalement interdit d'après le règlement de la prison), Mahone décide d'intervenir et parvient à se débarrasser de l'homme, sauvant ainsi Michael d'une mort certaine, puis déclare à Lechero, qui observait la scène d'en haut de son balcon, qu'il n'a fait que respecter le règlement de la prison et lui rappelle qu'aucune arme n'est autorisée lors d'un duel.

Plus tard, après la mort d'un prisonnier nommé "Tyge", Mahone est très vite soupçonné par Michael (il sera plus tard révélé qu'un homme de Lechero est le coupable) mais Whistler sera le premier suspect de Lechero. Michael, qui a besoin de garder Whistler en vie, dénoncera Mahone après avoir trouvé un couteau dans sa cellule. Mais heureusement pour Mahone, il sera transféré avant d'être interrogé.

Le manque de pilule de Mahone évolue de jour en jour et il en vient à acheter de la drogue à T-Bag (ayant pris la place de dealer de Sona après avoir assassiné Nieves, un sbire de Lechero).

Mahone réussit à obtenir une audience grâce à son ex-collègue, l'agent Lang et grâce à Richard Sullins: en échange de son témoignage contre Caroline Reynolds et le "Cartel", il bénéficierait d'une incarcération de 4 ans à Saint-Louis au lieu de 10 ans à Sona. Il perdra l'audience à cause de son manque trop important de Veratryle et sera reconduit à Sona. Il se remettra donc à travailler avec Michael et Whistler pour le plan d'évasion auquel s'est joint Lechero et bientôt T-Bag suivi de Bellick et Mc Grady.

Mahone réussit à vaincre sa dépendance au Veratryle, et devient un précieux allié pour Michael. Lorsque T-Bag, Lechero et Bellick menacent de tuer Whistler s'ils ne passent pas les premiers, Scofield demande à Mahone s'il veut aussi se joindre à eux mais ils refuse.

Alors que les premiers évadés se font arrêter, Mahone s'enfuit avec Michael, Whistler et McGrady. C'est Mahone qui aide Whistler à marcher car ce dernier fait faussement croire qu'il s'est tordu la cheville. Lincoln veut tuer Mahone car c'est lui qui a abattu le père des deux frères, mais l'évasion spectaculaire de James Whistler détourne l'attention, et permet à Alex Mahone de filer.

On le retrouve dans un bar où il boit un club soda, Whistler propose à Mahone de travailler avec lui contre le cartel, ce dernier accepte et part en voiture avec Whistler et Gretchen.